Von 1983 bis 1997: eine assoziative Verwaltung
Der Verein Folklore Comtois mobilisierte öffentliche Mittel und brachte erhebliche Vereinsmittel ein, um das Museum einzurichten und seinen Betrieb zu gewährleisten. Im Jahr 1997 übertrug der Verein das Museum an die öffentliche Hand, um seine Zukunft zu sichern und sich von einer zu umfangreich gewordenen Verwaltung zu befreien.
Die Vermittlung durch öffentliche Körperschaften
1997 wurde ein gemischtes Syndikat gegründet, das sich aus dem Generalrat des Departements Doubs, dem Distrikt Grand Besançon und der Gemeinde Nancray zusammensetzte. Heute besteht er zu gleichen Teilen aus dem Département Doubs und Grand Besançon Métropole.