Von 1983 bis 1997: Verwaltung durch einen Verein
Der Verein „Folklore comtois“ beschaffte öffentliche Mittel und stellte erhebliche Vereinsmittel für die Gründung des Museums und die Sicherstellung seines Betriebs bereit. Im Jahr 1997 übertrug der Verein das Museum an die öffentlichen Körperschaften, um sowohl dessen Zukunft zu sichern als auch sich von einer Verwaltung zu entlasten, die zu aufwendig geworden war.
Die Weiterleitung durch die öffentlichen Stellen
1997 wurde ein gemischter Zweckverband gegründet, der sich aus dem Generalrat des Departements Doubs, dem Bezirk Grand Besançon und der Gemeinde Nancray zusammensetzte. Heute setzt er sich zu gleichen Teilen aus dem Département Doubs und der Metropolregion Grand Besançon zusammen.
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